Telle une comptine pour apprendre la langue française, Caillou, chou, hibou place immédiatement les 5 courts métrages dans un rapport à l’enfance et à l’apprentissage. Tantôt sur les bancs de l’école, tantôt à l’autre bout de la galaxie, chaque lieu et chaque aventure sont l’occasion de découvrir le monde et les autres.